Pemugaran Candi Borobudur berskala besar dimulai pada tahun 1969 sebagai bagian dari Rencana Pembangunan Lima Tahun (Repelita atau PELITA), sebuah rencana pembangunan nasional yang diprakarsai oleh rezim Suharto untuk meningkatkan investasi dan mengembangkan infrastruktur negara. Tahap pertama dari proyek PELITA berjalan dari tahun 1969 s/d tahun 1974 dan berlanjut pada tahun 1994 dengan empat fase tambahan: Repelita II (1974–1979); Repelita III (1979–1984); Repelita IV (1984–1989); dan Repelita V (1989-1994). Semua proyek PELITA dibiayai oleh Badan Perencanaan Nasional (BAPPENAS).

Proyek Pemugaran Candi Borobudur dimasukkan dalam anggaran PELITA dari tahun 1969. Proyek ini merupakan bagian dari Proyek Pengembangun Kebudayaan Nasional, Direktorat Jendral Kebudayaan, Kementrian Pendidikan dan Kebudayaan. Pada tahun pertama, PELITA menyediakan anggaran sebesar Rp 50.000.000,00 yang tercantum dalam Daftar Isian Proyek no. 408 / XVI / I / 5/69 tanggal 28 Mei 1969 dengan nomer kode 04.001.161.03. sesuai dengan peraturan PELITA maka Gubenur Kepala Daerah Propinsi Jawa Tengah berstatus sebagai Pengawas Proyek Umum, sedangkan pengawasan proyek secara teknis diserahkan kepada Dinas Pemiliharaan dan Pemulihan Direktorat Purbakala dan Sejarah.